Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBM28Q9NW13 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM28Q9NW13 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM28Q9NW13 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms