Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXD2Q9NVH0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXD2Q9NVH0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXD2Q9NVH0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms