Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR9Q9NR96 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR9Q9NR96 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR9Q9NR96 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR9Q9NR96 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms