Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNB1IP1Q9NPC3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms