Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM8AQ9HCN3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM8AQ9HCN3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM8AQ9HCN3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms