Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMURF1Q9HCE7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SMURF1Q9HCE7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMURF1Q9HCE7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms