Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCAS3Q9H6U6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCAS3Q9H6U6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAS3Q9H6U6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms