Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LHX5Q9H2C1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX5Q9H2C1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX5Q9H2C1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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