Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED28Q9H204 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED28Q9H204 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED28Q9H204 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms