Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC90BQ9GZT6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC90BQ9GZT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC90BQ9GZT6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms