Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE41Q9C0J9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BHLHE41Q9C0J9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms