Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CIPCQ9C0C6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CIPCQ9C0C6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms