Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM7Q9C029 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM7Q9C029 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM7Q9C029 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms