Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PUS3Q9BZE2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PUS3Q9BZE2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PUS3Q9BZE2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms