Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SF3B5Q9BWJ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SF3B5Q9BWJ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms