Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HIRIP3Q9BW71 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HIRIP3Q9BW71 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
HIRIP3Q9BW71 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
HIRIP3Q9BW71 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HIRIP3Q9BW71 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms