Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf50Q9BV19 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf50Q9BV19 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf50Q9BV19 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms