Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2AFJQ9BTM1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2AFJQ9BTM1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2AFJQ9BTM1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2AFJQ9BTM1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms