Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CRACR2AQ9BSW2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRACR2AQ9BSW2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRACR2AQ9BSW2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRACR2AQ9BSW2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRACR2AQ9BSW2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRACR2AQ9BSW2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CRACR2AQ9BSW2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms