Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK0

REEP2, Receptor expression-enhancing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP2Q9BRK0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
REEP2Q9BRK0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
REEP2Q9BRK0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
REEP2Q9BRK0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms