Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPAS1Q99742 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms