Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM209Q96SK2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM209Q96SK2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.3 ms