Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMF1Q96S06 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMF1Q96S06 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms