Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
YTHDC1Q96MU7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
YTHDC1Q96MU7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
YTHDC1Q96MU7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms