Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP57Q96MR6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms