Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf85Q96MD7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf85Q96MD7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf85Q96MD7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms