Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC114Q96M63 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC114Q96M63 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC114Q96M63 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms