Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCORQ96JN0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCORQ96JN0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms