Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHAMP1Q96JM3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHAMP1Q96JM3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHAMP1Q96JM3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAMP1Q96JM3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms