Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ASIC4Q96FT7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms