Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ULK4Q96C45 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ULK4Q96C45 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ULK4Q96C45 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms