Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB7BQ96AH8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB7BQ96AH8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB7BQ96AH8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms