Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM52Q96A61 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM52Q96A61 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM52Q96A61 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms