Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP1MTQ969P6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP1MTQ969P6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOP1MTQ969P6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms