Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXT2Q93063 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXT2Q93063 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXT2Q93063 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms