Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAD50Q92878 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD50Q92878 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms