Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIFAP3Q92845 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIFAP3Q92845 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIFAP3Q92845 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms