Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GIPC3Q8TF64 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GIPC3Q8TF64 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms