Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTRT1Q8TDG2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTRT1Q8TDG2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms