Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCL4L1Q8NHW4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL4L1Q8NHW4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL4L1Q8NHW4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms