Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM58Q8NG06 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM58Q8NG06 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM58Q8NG06 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms