Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRFBP1Q8NEF9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRFBP1Q8NEF9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms