Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZIC4Q8N9L1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms