Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RYBPQ8N488 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RYBPQ8N488 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RYBPQ8N488 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms