Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC47Q8N1G4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC47Q8N1G4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC47Q8N1G4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC47Q8N1G4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC47Q8N1G4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC47Q8N1G4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC47Q8N1G4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC47Q8N1G4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms