Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHACTR4Q8IZ21 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHACTR4Q8IZ21 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms