Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXL6

FAM20C, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20CQ8IXL6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20CQ8IXL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM20CQ8IXL6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM20CQ8IXL6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM20CQ8IXL6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20CQ8IXL6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20CQ8IXL6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20CQ8IXL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20CQ8IXL6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20CQ8IXL6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM20CQ8IXL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM20CQ8IXL6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms