Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC9A9Q8IVB4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC9A9Q8IVB4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A9Q8IVB4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms