Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC49Q8IUZ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC49Q8IUZ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC49Q8IUZ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms