Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRLF3Q8IUI8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRLF3Q8IUI8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRLF3Q8IUI8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1135.1 ms